Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
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Ubxn4Q8VCH8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
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