Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Rdh10Q8VCH7 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Rdh10Q8VCH7 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Rdh10Q8VCH7 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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