Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Rab11fip5Q8R361 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab11fip5Q8R361 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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