Protein–RNA interactions for Protein: Q8K406

Lgi3, Leucine-rich repeat LGI family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi3Q8K406 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lgi3Q8K406 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lgi3Q8K406 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lgi3Q8K406 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lgi3Q8K406 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lgi3Q8K406 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lgi3Q8K406 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lgi3Q8K406 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lgi3Q8K406 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lgi3Q8K406 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lgi3Q8K406 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lgi3Q8K406 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lgi3Q8K406 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lgi3Q8K406 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lgi3Q8K406 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lgi3Q8K406 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lgi3Q8K406 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lgi3Q8K406 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lgi3Q8K406 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lgi3Q8K406 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lgi3Q8K406 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lgi3Q8K406 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lgi3Q8K406 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lgi3Q8K406 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lgi3Q8K406 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lgi3Q8K406 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lgi3Q8K406 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lgi3Q8K406 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lgi3Q8K406 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lgi3Q8K406 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lgi3Q8K406 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lgi3Q8K406 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lgi3Q8K406 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lgi3Q8K406 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms