Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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