Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I2

Cchcr1, Coiled-coil alpha-helical rod protein 1, mousemouse

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Length 770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cchcr1Q8K2I2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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