Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms