Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms