Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms