Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms