Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKS9

Pum3, Pumilio homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pum3Q8BKS9 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pum3Q8BKS9 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms