Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH75

Rnf41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf41Q8BH75 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms