Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed4Q80WQ9 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms