Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms