Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Krt77Q6IFZ6 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms