Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Pdzrn3Q69ZS0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Pdzrn3Q69ZS0 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Pdzrn3Q69ZS0 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Pdzrn3Q69ZS0 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Pdzrn3Q69ZS0 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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