Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms