Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gbp4Q61107 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gbp4Q61107 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gbp4Q61107 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gbp4Q61107 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gbp4Q61107 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gbp4Q61107 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4Q61107 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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