Protein–RNA interactions for Protein: Q60841

Reln, Reelin, mousemouse

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Length 3,461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelnQ60841 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RelnQ60841 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Gm8824-201ENSMUST00000182962 990 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RelnQ60841 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RelnQ60841 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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RelnQ60841 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RelnQ60841 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RelnQ60841 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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RelnQ60841 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RelnQ60841 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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RelnQ60841 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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RelnQ60841 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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RelnQ60841 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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RelnQ60841 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RelnQ60841 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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