Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Speer4c-201ENSMUST00000095005 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Tsr1Q5SWD9 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Tsr1Q5SWD9 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Tsr1Q5SWD9 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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Tsr1Q5SWD9 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Tsr1Q5SWD9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Tsr1Q5SWD9 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Tsr1Q5SWD9 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms