Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms