Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
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Trappc1Q5NCF2 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
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Trappc1Q5NCF2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
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Trappc1Q5NCF2 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
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Trappc1Q5NCF2 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
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