Protein–RNA interactions for Protein: Q505G4

Rtl6, Retrotransposon Gag-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl6Q505G4 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Rtl6Q505G4 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtl6Q505G4 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtl6Q505G4 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rtl6Q505G4 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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