Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms