Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Acsf3Q3URE1 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Acsf3Q3URE1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Acsf3Q3URE1 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms