Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 1,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrc4Q3UP24 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms