Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms