Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms