Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
InipQ3TXT3 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
InipQ3TXT3 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
InipQ3TXT3 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
InipQ3TXT3 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
InipQ3TXT3 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
InipQ3TXT3 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms