Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms