Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Rbp2Q08652 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rbp2Q08652 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rbp2Q08652 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rbp2Q08652 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rbp2Q08652 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rbp2Q08652 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rbp2Q08652 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rbp2Q08652 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rbp2Q08652 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rbp2Q08652 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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