Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gjb5Q02739 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms