Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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GscQ02591 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GscQ02591 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GscQ02591 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GscQ02591 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GscQ02591 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GscQ02591 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GscQ02591 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GscQ02591 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GscQ02591 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GscQ02591 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GscQ02591 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GscQ02591 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GscQ02591 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GscQ02591 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GscQ02591 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GscQ02591 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
GscQ02591 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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GscQ02591 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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GscQ02591 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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GscQ02591 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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GscQ02591 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GscQ02591 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GscQ02591 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GscQ02591 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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GscQ02591 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GscQ02591 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GscQ02591 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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GscQ02591 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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GscQ02591 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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GscQ02591 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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GscQ02591 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GscQ02591 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GscQ02591 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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GscQ02591 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GscQ02591 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GscQ02591 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GscQ02591 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GscQ02591 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GscQ02591 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GscQ02591 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GscQ02591 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GscQ02591 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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GscQ02591 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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GscQ02591 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
GscQ02591 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms