Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms