Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mc1rQ01727 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.5 ms