Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms