Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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