Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms