Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms