Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms