Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps11P62281 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps11P62281 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps11P62281 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms