Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf5P56477 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf5P56477 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf5P56477 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf5P56477 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf5P56477 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Irf5P56477 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Irf5P56477 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Irf5P56477 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Irf5P56477 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf5P56477 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf5P56477 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf5P56477 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Irf5P56477 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Irf5P56477 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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