Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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