Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtbP41155 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtbP41155 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtbP41155 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtbP41155 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtbP41155 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtbP41155 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtbP41155 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtbP41155 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtbP41155 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtbP41155 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtbP41155 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtbP41155 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtbP41155 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtbP41155 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtbP41155 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtbP41155 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
LtbP41155 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtbP41155 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtbP41155 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtbP41155 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtbP41155 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtbP41155 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtbP41155 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtbP41155 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtbP41155 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtbP41155 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtbP41155 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtbP41155 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtbP41155 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtbP41155 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtbP41155 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtbP41155 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtbP41155 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtbP41155 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtbP41155 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtbP41155 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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