Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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