Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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