Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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PdgfraP26618 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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PdgfraP26618 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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PdgfraP26618 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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