Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmnb2P21619 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms