Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms