Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
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